199697赛季拜仁慕尼黑-战平阿贾克斯，争夺小组第一悬念莫测，特拉帕托尼重返球队并带领拜仁捧起拜仁慕尼黑-战平阿贾克斯，争夺小组第一悬念莫测了当年拜仁慕尼黑-战平阿贾克斯，争夺小组第一悬念莫测的德甲冠军奖盘但在接下来的一个赛季，拜仁在冠军争夺战中输给了雷哈格尔带领的升级马凯泽斯劳滕，特拉帕托尼也再次离开了俱乐部 在19982004年间，拜仁由奥特马·希斯菲尔德执教在他米兰体育执教的第一个赛季，拜仁获得了当年的德甲联赛冠军，欧洲冠军联赛冠军也几乎到手。
1 拜仁慕尼黑已确保小组头名，那不勒斯排名第二，曼城排名第三，比利亚雷亚尔垫底末轮对阵曼城VS拜仁慕尼黑，比利亚雷亚尔VS那不勒斯曼城必须击败拜仁慕尼黑才有出线可能，而那不勒斯只需战平即可确保出线2 国米领跑小组，特拉布宗体育排名第二，里尔和中央陆军排名第三末轮对阵里尔VS特拉布宗。
2006年8月19日，200607赛季德甲第2轮客场对阵亚琛队，由于主力门将罗斯特小腿受伤，诺伊尔迎来个人职业比赛处子秀，帮助沙尔克04客场10胜亚琛队，从第10轮主场22战平拜仁慕尼黑一战开始，诺伊尔彻底取代罗斯特成为沙尔克04一号门将200607赛季有13场比赛保持球门不失，扑救成功率高达786%200607。
在小组赛中，他们与西班牙巴塞罗那Juvenil B梯队战成00，接着以04不敌荷兰阿贾克斯B1梯队，之后以10的比分击败了英格兰利物浦U17，10击败了德国拜仁慕尼黑U17半决赛中，他们以01的比分败给了荷兰阿贾克斯B1梯队，在决赛中再次以01的比分输掉了比赛在2011年的比赛中，中国93国青队参加了第。
由于199192赛季以后欧冠引入资格赛小组赛制，以上球员进球数不包括资格赛进球其中一些赛季的球员进球差的球队，他们在1981至82年赛季一比零击败拜仁慕尼黑夺得欧冠杯冠军，但另一方面在英甲联赛只取得第十一20112012赛季欧冠小组赛曼联客场11战平本菲卡队的比赛中，37岁零289天的吉格斯在第42分钟为曼联扳平。
别看现在的拜仁慕尼黑队已成为无可争议的绿茵豪门，但在1963年西德职业联赛建立之初的时候，根据西德足协的规定，每座城市只能选派一支球队参赛，慕尼黑的代表并不是拜仁，而是1860队1964年，慕尼黑1860对队的老板纽德克尔连续两年拒绝在自己的俱乐部中推行职业化夺得了德国杯赛的冠军，第二年还进入了欧洲冠军杯赛的决赛，但。
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